Pendekatan Struktur Aktivitas dan Penambatan Molekul Senyawa 2-iminoethyl 2-(2-(1-hydroxypentan-2-yl) phenyl)acetate Hasil Isolasi Fungi Endofit Genus Fusarium sp pada Enzim β-ketoasil-ACP KasA Sintase
Abstract
Fungi endofit dapat memproduksi senyawa yang memiliki aktivitas biologi, diantaranya senyawa flavonoid, alkaloid, fenolik, dan terpenoid. Fungi endofit genus Fusarium sp yang diisolasi dari daun tanaman meniran menghasilkan senyawa 2-iminoethyl 2-(2-(1-hydroxypentan-2-yl) phenyl)acetate yang mempunyai aktivitas dapat menghambat pertumbuhan bakteri Mycobacterium tuberculosis dengan nilai EC50 sebesar 18,98 µM. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui mekanisme aksi senyawa 2-iminoethyl 2-(2-(1-hydroxypentan-2-yl) phenyl)acetate pada enzim asam siklopropan mikolik sintase dan β-ketoasil-ACP KasA sintase. Enzim asam siklopropan mikolik sintase dan enzim β-ketoasil-ACP KasA sintase memiliki andil yang besar dalam pembentukan asam mikolat, bila aktivitas kedua enzim terhambat maka pembentukan asam mikolat juga akan terhambat sehingga dapat menyebabkan kematian pada bakteri Mycobacterium tuberculosis. Pendekatan dilakukan dengan metode penambatan molekul (molecular docking) dengan didahului optimasi dan validasi metode. Reseptor yang digunakan adalah 2WGE dan 3HEM yang didapat dari Protein Data Bank. Hasil analisis menunjukan senyawa 2-iminoethyl 2-(2-(1-hydroxypentan-2-yl) phenyl)acetate mampu berikatan dengan lebih baik terhadap enzim asam mikolik siklopropan sintase dan enzim β-ketoasil-ACP KasA sintase dibandingkan dengan positif dan native ligand. Dari analsis tersebut disimpulkan bahwa senyawa 2-iminoethyl 2-(2-(1-hydroxypentan-2-yl) phenyl)acetate mampu bertindak sebagai inhibitor enzim asam mikolik siklopropan sintase dan enzim β-ketoasil-ACP KasA sintase pada bakteri Mycobacterium tuberculosis secara in-silico.
References
Ren, C.L., Konstan, M.W., Yegin, A., Rasouliyan, L., Trzaskoma, B., Morgan, W.J., dkk., 2012. Multiple antibiotic-resistant Pseudomonas aeruginosa and lung function decline in patients with cystic fibrosis. Journal of Cystic Fibrosis, 11: 293–299.
Iwamoto, M., Mu, Y., Lynfield, R., Bulens, S.N., Nadle, J., Aragon, D., dkk., 2013. Trends in invasive methicillin-resistant Staphylococcus aureus infections. Pediatrics, 132: e817–824.
Tanaka, M., Sukiman, H., Saito, M., Suto, K., Prana, M., dan Tomita, F., 1999. Isolation, Screening and Phylogene-tic Identification of Endophytes from Plants in Hokaido Japan and Java Indonesia. Microbes and Environment, 14: 237–241.
Tan, R.X. dan Zou, W.X., 2001. Endophytes: a rich source of functional metabolites. Natural product reports, 18: 448–459.
Strobel, G.A., 2003. Endophytes as sources of bioactive products. Microbes and infection / Institut Pasteur, 5: 535–544.
Sebastianes, F.L.S., Cabedo, N., El Aouad, N., Valente, A.M.M.P., Lacava, P.T., Azevedo, J.L., dkk., 2012. 3-hydroxypropionic acid as an antibacterial agent from endophytic fungi Diaporthe phaseolorum. Current microbiology, 65: 622–632.
Rollando,R.,Aditya,M.,,Notario,D.,Monica,E.,Sitepu,R.,2017. Penelusuran aktivitas antibakteri, antioksidan, dan sitotoksik fungi endofit genus fusarium sp. diisolasi dari daun meniran (Phyllantus niruri Linn.), Pharmaciana, 7 :95-104.
Rollando,R.,Notario,D.,Monica,E., Aditya,M .,Sitepu,R.,2017. Antimicrobial, antioxidant, and cytotoxic activities of endhopitic fungi Chaetomium sp. isolated from Phyllanthus niruri Linn: in vitro and in silico studies, The journal of pure and applied chemistry research, 6 : 64-83.
Chintu, C., Luo, C., Bhat, G., Raviglione, M., DuPont, H., dan Zumla, A., 1993. Cutaneous hypersensitivity reactions due to thiacetazone in the treatment of tuberculosis in Zambian children infected with HIV-I. Archives of Disease in Childhood, 68: 665–668.
Alahari, A., Trivelli, X., Guérardel, Y., Dover, L.G., Besra, G.S., Sacchettini, J.C., dkk., 2007. Thiacetazone, an antitubercular drug that inhibits cyclopropanation of cell wall mycolic acids in mycobacteria. PloS One, 2: e1343.
Grzegorzewicz, A.E., Korduláková, J., Jones, V., Born, S.E.M., Belardinelli, J.M., Vaquié, A., dkk., 2012. A common mechanism of inhibition of the Mycobacterium tuberculosis mycolic acid biosynthetic pathway by isoxyl and thiacetazone. The Journal of Biological Chemistry, 287: 38434–38441.
Luckner, S.R., Machutta, C.A., Tonge, P.J., dan Kisker, C., 2009. Crystal Structures of Mycobacterium Tuberculosis KasA Show Mode of Action within Cell Wall Biosynthesis and its Inhibition by Thiolactomycin. Structure, 17: 1004–null.
Barkan, D., Liu, Z., Sacchettini, J.C., dan Glickman, M.S., 2009. Structure of Mycobacterium tuberculosis Mycolic Acid Cyclopropane Synthase CmaA2 in Complex with Dioctylamine.
Istyastono, E.., Yuniarti, N., dan Jumina, 2009. Sintesis Senyawa Berpotensi sebagai Inhibitor Angiogenesis : 2-benzilidenasikloheksana-1,3-dion. Majalah Farmasi Indonesia, (1–8).
.png)
